一文读懂 NGS 文库制备核心原料：磁珠

在NGS 文库构建、核酸纯化、片段筛选与靶向捕获的实验流程中，磁珠是核心关键原料，该原料的品类选择、使用方法与性能优劣决定文库质量、测序数据有效性及实验重复性。你都用过哪些磁珠呢？

按照应用功能结合表面修饰基团划分，NGS 流程中常用磁珠可分为四大类：核酸提取磁珠（硅羟基、羧基修饰）、片段筛选与纯化磁珠（羧基修饰）、Oligo (dT) mRNA 富集磁珠、链霉亲和素捕获磁珠。

1. 硅羟基 / 羧基核酸提取磁珠

硅羟基核酸提取磁珠：以硅羟基为功能修饰基团，依托经典硅-核酸特异性吸附原理发挥作用，适配全血、组织、FFPE、拭子、血浆等各类临床复杂样本.

羧基核酸提取磁珠：以表面羧基修饰为核心功能结构，依靠PEG-盐离子体系介导核酸可逆吸附，吸附条件温和、非特异性结合低.

2. SPRI 片段筛选 & 纯化磁珠

采用固相可逆固定化（SPRI） 技术，磁珠悬浮于 PEG - 盐缓冲体系，可可逆吸附核酸。如 AMPure XP、SPRIselect，是 NGS 建库使用量最大的磁珠。

• 纯化（Clean up）：去除 PCR 引物、引物二聚体、盐离子与酶残留，常规可稳定保留 100 bp 以上核酸片段；

• 片段筛选（Size selection）：通过调控磁珠添加比例，精准截留目标长度文库片段，适配超声破碎后 DNA 片段分选，满足大部分文库区间 200~400 bp。

3. Oligo (dT) mRNA 富集磁珠

表面偶联寡聚 dT 序列，特异性结合带 polyA 尾的 mRNA，多用于转录组测序、RNA 建库，实现 mRNA 富集、去除 rRNA 干扰，提升 RNA 文库有效数据占比。

4. 链霉亲和素磁珠

依靠链霉亲和素与生物素的强特异性结合作用，搭配生物素化探针完成杂交捕获，广泛应用于靶向测序（tNGS）、肿瘤、遗传病及病原靶向检测，实现目标核酸序列的定向富集。

1. 单侧筛选（保留大片段、去除小片段）

2. 单侧筛选（保留小片段、去除大片段）

3. 双侧筛选（区间片段富集）

随着基因诊断、个性化给药等技术的快速发展，追求自动化、高通量成为大家的共同

追求的目标。这给磁珠带来了更多应用场景，无论是在核酸提取、化学发光、分子诊断、NGS 我们都可以看到磁珠的身影。

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